Im Hirnstamm (Verbindung zwischen Gehirn und Rückenmark) laufen unter anderem Nervenfasern für die Berührungsempfindlichkeit des Gesichtes. Werden diese von MS befallen, kann es zu heftigen Schmerzattacken im Gesicht kommen, besonders eben bei Berührung, dabei reicht dann schon der Kontakt von längeren Haaren. Durch den Befall der Nerven, die die Gesichtsmuskulatur versorgen, kann es zur Gesichtslähmung kommen.
Schwindel und Brechreiz können vorkommen, wenn die Nervenbahnen geschädigt werden, die eine Verbindung zum Gleichgewichtsorgan herstellen. Entzündungsherde im Hirnstamm können weiterhin zu einer verwaschenen Sprache führen. Es kann auch zu Sprachstörungen kommen, die nur für kurze Zeit, oft mehrmals am Tag, auftreten.